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吐鲁番驴是新疆驴主要品种之一。吐鲁番驴适应性特别强，既能忍受吐鲁番盆地夏季的酷暑炎热，也能适应高寒牧区冬季－40℃严寒。据不完全统计1978—2008年输往陕西、河南、河北、甘肃、山东、江苏等省的吐鲁番驴近十万头，在各地均表现出良好的适应性和役用能力。
吐鲁番驴体格高大，外形美观，头稍长，耳较短，鼻孔大，体驱发育好。毛色以黑、棕色较多，亦有浅灰色、灰色及棕灰色。据658头驴毛色的统计，黑色360头，占54.7%；棕色167头，占25.4%；浅灰色53头，占8%；灰色45头，占6.9%，棕灰色33头，占5%。
新疆驴以体高在110厘米以下的小型驴居多。吐鲁番驴部分体高达125－140厘米以上的大中型驴，多为挽驮兼用型。在658头吐鲁番驴调查中，体高低于118厘米的211头，占32.1%；体高在120－128厘米的263头，占39.9%；体高在129－145厘米的184头，占28%。体长平均达130厘米，胸围平均达148厘米，管为平均达17.1厘米。吐鲁番驴生长出生后第一年生长较快，一岁时体高达到成年驴的90%以上，两岁时体高接近成年驴，两岁后，后体躯向宽深发育。由于其体格较大。和新疆其他驴相比，生长发育较迟，一般到2.5岁才能达到体成熟。
吐鲁番驴是当地农牧民的主要短途交通运输工具之一，常用于拉车、承骑，体格大的还用于犁地，在农业生产过程中起过重要作用。据测定常年使役的吐鲁番驴，在石子路上，能单套拉运700公斤重的货物。每头驴驮重90公斤，五小时行程28公里，短距离最大驮重可达165公斤。在气温30℃的晴朗天气时，双套拉犁翻粘砂土地，耕深10－22厘米，宽20－32厘米，日工作8小时，能耕翻6亩多地。
公母驴体型较大，性成熟较晚。公母驴在1.5周岁时便有性行为。公驴2.5－3岁时参加配种，配种能力较强，母驴两周岁时参加配种，繁育年龄可到12－15岁，终身可产驴8—10胎，在贫乏饲养条件下，怀胎母驴很少发生营养性流产，幼驴成活率一般在98%以上。